Za razliku od drugih komunisticki drzava u SFRJ nije zakonski niti zvanicno bile zabranjene religije. Sve religije su postojale i postojalo je ministarstvo za odnose sa religijama, koje je regulisalo da religije ne prerastu u fasizam. Ali poslije u kriticnim vremenima agresije na BiH, politikom islamizacije armije SDA je kao narucena potvrdila optuzbe srpskog rukovodstva kod EU vodecih drzava, prvensveno Francuske i V. Britanije o islamskoj drzavi. Podrska odbrani BiH od EU je izostala.