Hrvati u BiH, a pogotovo Hrvati u Hercegovini su autohtoni satrosjedioci te će uvijek biti konstitutivan narod u BiH jer je to uvjetovano genetikom. Prema znanstvenim istraživanjima, među Hrvatima Hercegovine dominira 89% I2a i R1a haplogrupa (dinarsko-slavenski genotip), a među BiH muslimanima 59% ima dinarsko-slavensku haplogrupu, ostalih 41% BiH muslimana ima vlaške, turske i albanske haplogrupe.