U grupi D Hertha je domaćom pobjedom nad Sporting 1:0 uhvatila drugo mjesto i prolaz dalje, dok je Sporting već ranije osigurao prvo mjesto u grupi.
Uoči zadnjeg kola Roma, Fulham i Basel bili su u igri za prva dva mjesta u grupi E, a na kraju je Roma došla do prvog mjesta pobjedom 3:0 na gostovanju kod CSKA Sofije, dok je u izravnom obračunu Fulham slavio kod Basel 3:2 i prošao dalje.
Panathinaikos je uvjerljivom domaćom pobjedom 3:0 nad Dinamom iz Bukurešt došao do drugog mjesta u grupi F u kojoj je ranije Galatasaray osigurao čelnu poziciju.
U grupi J beogradski Partizan ubilježio je prve bodove pobijedivši na svom terenu Šahtar 1:0, no ova utakmica nije imala značaj za rasplet u skupini jer su Ukrajinci ranije potvrdili prvo mjesto, a Partizan je bio bez ikakvih izgleda za prolaz dalje. Drugo mjesto iza Šahtar osvojio je belgijski Club Brugge koji je s 1:0 porazio Toulouse.
U izravnom dvoboju za drugo mjesto u grupi K Kopenhagen je na gostovanju kod praške Sparte pobijedio 3:0 i prošao dalje zajedno s pobjednikom grupe PSV Eindhovenom.
Iz grupe L nastup u šesnaestini finala ranije su izborili Athletic Bilbao i Werder Bremen, a u sinoćnjem međusobnom dvoboju Werder je u gostima slavio 3:0 i tako potvrdio prvo mjesto na tabeli.
Grupa D:
Hertha - Sporting 1:0 (Kačar 70) Heerenveen - Ventspils 5:0 (Vaayrynen 55, Elm 58, Sibon 77, 78, Janmaat 88)
- Sporting 6 3 2 1 8:6 11
- Hertha 6 3 1 2 6:5 10
- Heerenveen 6 2 2 2 11:7 8
- Ventspils 6 0 3 3 3:10 3
Grupa E:
CSKA Sofija - Roma 0:3 (Cerci 45+1, 52, Scardina 89) Basel - Fulham 2:3 (Frei 64-11m, Streller 87 / Zamora 42, 45, Gera 77)
- Roma 6 4 1 1 10:5 13
- Fulham 6 3 2 1 8:6 11
- Basel 6 3 0 3 10:7 9
- CSKA Sofija 6 0 1 5 2:12 1
Grupa F:
Sturm - Galatasaray 1:0 (Beichler 21) Panathinaikos - Dinamo Bukurešt 3:0 (Rukavina 54, Cisse 80, 85)
- Galatasaray 6 4 1 1 12:4 13
- Panathinaikos 6 4 0 2 7:4 12
- Dinamo Bukurešt 6 2 0 4 4:12 6
- Sturm 6 1 1 4 3:6 4
Grupa J:
Club Brugge - Toulouse 1:0 (Perišić 90+3) Partizan - Šahtar 1:0 (Diarra 6)
- Šahtar 6 4 1 1 14:3 13
- Club Brugge 6 3 2 1 10:8 11
- Toulouse 6 2 1 3 6:11 7
- Partizan 6 1 0 5 6:14 3
Grupa K:
CFR Cluj - PSV Eindhoven 0:2 (Lazović 19-11m, Amrabat 68) Sparta - FC Kopenhagen 0:3 (N'Doye 22, 30, Gronkjaer 54-11m)
- PSV Eindhoven 6 4 2 0 9:3 14
- FC Kopenhagen 6 3 1 2 7:4 10
- Sparta 6 2 1 3 7:9 7
- CFR Cluj 6 1 0 5 4:11 3
Grupa L
Nacional - Austria Beč 5:1 (Ruben Micael 23, 57, Mateus 33, Tomašević 61, Felipe Lopes 66 / Schumacher 21) Athletic - Werder 0:3 (Pizarro 13, Naldo 21, Rosenberg 36)
- Werder 6 5 1 0 17:6 16
- Athletic 6 3 1 2 10:8 10
- Nacional 6 1 2 3 11:12 5
- Austria Beč 6 0 2 4 4:16 2