Baradej ti je 2003 na čelu komisije za Irak došao nakon kontrolisanja Iraka, i u lice Georgu Bush rekao da Irak nema ništa od atomskog ili bilo kojeg drugog oružja za masovno uništenje. Naravno, predsjednik SAD-a je bio Bush a ne Baradej, pa je tako uslijedila američka invazija na Irak. Baradej je pred UN-om uporno vikao da u Iraku njgova inspekcija nije našla nikakvog opasnog oružja kao što je uzvikivao Bush da pokrene invaziju.