Također u periodu poslije nezavisnosti dolazi do brojnih vojnih prevrata. Godine 1963. Sirija je došla pod vlast Ba\'s partije, arapskih socijalista, koja svoju filozofiju gradi na arapskom nacionalizmu u kojem nema mjesta za vjere, a naročito nema mjesta za islam. Također su naginjali ljevičarskom komunizmu koji je zagovarao javno propagiranje ateizma i vrijeđanje islama. Godine 1970. dolazi do vojnoga prevrata u kojem na vlast dolazi nusejrija Hafiz Esed i ostaje na njoj do svoje smrti 2000. godine, a nasljeđuje ga njegov sin Beššar Esed koji se zadržao na vlasti sve do danas. Inače, Hafiz Esed pripremao je svoga sina Basila Eseda za vlast, ali je on poginuo u saobraćajnoj nesreći i onda je na vlast došao Beššar Esed koji je inače po zanimanju oftalmolog i vojno lice.