Na zakazanoj raspravi po pravilu 98 bis branitelji optuženih će tražiti da se njihovi klijenti oslobode optužbi koje, po njihovom mišljenju, tužitelj nije uspio dokazati. Potom slijedi stanka u suđenju, o čijem trajanju se Pretresno vijeće još uvijek nije izjasnilo, a nakon koje počinje dokazni postupak obrane.
Posljednja dva dana suđenje bivšim liderima Herceg-Bosne bilo je zatvoreno za javnost zbog svjedočenja zaštićenog svjedoka.
Suđenje je počelo 26. aprila 2006. godine i trajalo je 246 "sudskih" dana ili oko 1.000 sati, budući da zasjedanja traju 4 sata dnevno. Od tog vremena, Tužiteljstvo je na izvođenje svojih dokaza utrošilo 295 sati, tokom kojih je saslušano 145 svjedoka. U dokaze je uvršteno i oko 60 pisanih izjava svjedoka, kao i više od 4.200 različitih dokaznih predmeta.
Bivše lidere bosanskohercegovačkih Hrvata optužnica tereti za zločine počinjene nad bošnjačkim stanovništvom u srednjoj Bosni i zapadnoj Hercegovini.