Bakterije uvijek mutiraju i time vremenom postanu otporne na postojece antibiotike.
Sto se vise antibiotici koriste to je veca vjerovatnoca da ce bakterije postati imune na iste. Rjesenje (ili bar usporavanje) problema je sto manje koristiti antibiotike odnosno samo u prijekoj potrebi. Najveca perverzija je uzimati antibiotike kod virusnih oboljenja (npr. gripe) jer nista ne pomazu.