BiH sistem uređenja za visoko obrazovanje kritiziran je zbog prevelike decentralizacije, što uzrokuje fragmentaciju, politizaciju, korupciju i neravnomjerno finansiranje, sprječavajući napredak i Bolonjski proces. Javni sektor u BiH je neefikasan, sa visokim troškovima (preko 40% BDP-a) i lošim rangiranjem (137. mjesto po Globalnom indeksu konkurentnosti). Mali kantoni poput BPK Goraždea pate od manjka kadra i resursa, što pojačava podkapacitet na svim nivoima.