Sud je zaključio da su pripadnici HVO-a počinili teške zločine protiv Bošnjaka: etničko čišćenje, prisilno premještanje, zatvaranje u logore (Dretelj, Heliodrom, Gabela), silovanja, ubistva, napadi na civilne ciljeve (npr. Mostar). U presudi se navodi da su u UZP-u učestvovali visoki dužnosnici Republike Hrvatske, uključujući: Franjo Tuđman (predsjednik RH) Gojko Šušak (ministar obrane) Janko Bobetko (general HV-a)