Također, više stotina žalbi roditelja je upućeno i Helsinškom komitetu BiH. U ovim žalbama roditelji ističu da je odluka ministra Suljagića o diskriminaciji vjeronauke donešena pred sam kraj školske godine čime je prekršeno osnovno pravo učenika da za svoj trud tokom cijele školske godine na kraju budu adekvatno i nagrađeni tj. ocijenjeni, kao i da je prekršeno osnovno pravo na mogućnost izbora, jer je odluka jednostrana.