Vojska je saopćila da je uhapsila više od 60 drugih tokom operacija u saveznim državama Adamava i Jobe, javio je BBC.
Islamistička grupa se protivi zapadnjačkom utjecaju u Nigeriji i izvršila je niz napada.
U nedjelju je u napadu na katoličku crkvu na sjeveru, u kojem su poginule dvije osobe, okrivljena grupa Boko Haram.
Vojni glasnogovornik je rekao za AFP da se operacija dogodila tokom noći s nedjelje na ponedjeljak, a uveden je policijski sat u Damaturu, prijestolnici države Jobe, uoči operacije.
Vojnici su išli od kuće do kuće u tri naselja i razmjenjivali su vatru s ekstremistima tokom cijele noći. U sukobima su ranjena dva vojnika.
U skloništima Boko Harama pronađeni su deseci pušaka i eksplozivnih naprava i više stotina komada municije, kao i 32 strijele i dva mača.