Devetorica ostalih marinaca su ranjena i najmanje četvorica pobunjenika su ubijena tokom incidenta na otoku Basilan, javio je BBC.
Sukob se desio dok su marinci tragali za italijanskim svećenikom.
Svećenika su oteli u junu kidnaperi za koje se vjeruje da su ili iz Abu Sayyafa ili Moro oslobodilačkog islamskog fronta.
Obje grupe bore se za nezavisnu islamsku državu na južnim Filipinima.
Svećenika Giancarla Bossija oteli su naoružani ljudi u blizini priobalnog sela Bulawan u blizini Zamboange 10. juna.
Otac Bossi otet je na putu ka crkvi.
Marinski portparol, potpukovnik Ariel Caculitan, izjavio je da su marinci upali u grupu od oko 300 naoružanih ljudi tokom potrage za svećenikom, izazivajući sukob.
Potpukovnik Caculitan izjavio je da je 14 marinaca ubijeno. Broj ubijenih pobunjenika nije potvrđen, ali izvještaji variraju od četiri do najmanje 20.
Vojska je prvobitno pretpostavila da su pobunjenici iz grupe Abu Sayyaf - najmanje ali najsmrtonosnije od nekoliko islamskih grupa koje se bore protiv filipinske vlade.
Portparol Moro oslobodilačkog islamskog fronta (MILF) kasnije je potvrdio da su neki od njegovih pripadnika učestvovali u bici uprkos činjenici da je MILF trenutno angažovan u mirovnim pregovorima s vladom.
Mohagher Iqbal, šef pregovarača MILF-a, izjavio je da su marinci napali jedno od uporišta grupe, kršeći sporazum o primirju, te da su njegove snage uzvratile.
"Incident se mogao izbjeći da je vlada koordinirala s našim snagama u Basilanu prije nego što su se njene snage pokrenule", izjavio je on novinarima.
On je, međutim, negirao da je MILF odgovoran za odrubljivanja glava, ili da je na bilo koji način umiješan u otmicu svećenika.
Dolazi li Bolt u Sarajevo? Glavni Uberov konkurent traži vozače u glavnom gradu BiH
