Naime, u Hadžića je pucano iz neposredne blizine sa sedam metaka kalibra 7,65 milimetara. Svjedoka ovog ubistva nema, a beživotno tijelo u automobilu "golf 5" pronašli su radnici koji su pošli obrađivati obližnji vinograd.
Hadžić je, inače, bio jedan od optuženih u sudskom procesu u slučaju ubistva Blaška Knezovića, koji je ubijen sa tri metka u noći između 3. i 4. februara 2003. godine. I Knezović je, kao i Hadžić, ubijen u svom automobilu, parkiranom na makadamskom putu u blizini Širokog Brijega. Za saučesništvo u ovom ubistvu Sanja Vuleta iz Busovače osuđena je u mostarskom Kantonalnom sudu na deset godina zatvora, dok su Emir Hadžić i Oliver Jakešević oslobođeni optužbe.
Protiv Hadžića je istragu vodilo i Tužilaštvo BiH zbog sumnje da je umiješan u krađe i ilegalno prebacivanja automobila preko granice, te za krivotvorenje dokumenata za vozila.