Planom poslovanja ovog preduzeća za 2009. godinu, koji je na posljednjoj sjednici razmatrala i dala saglasnost Vlada FBiH, predviđeno je da se preveze 593.000 putnika i ostvari 45,4 miliona putničkih kilometara.
Planira se također povećanje udjela u transportu masovnog prijevoza robe, naročito u dijelu prijevoza za potrebe teške bazne industrije i prijevoza nafte.
Načelno, Plan poslovanja JP Željeznice FBiH za 2009. ne predviđa značajnija povećanja u odnosu na 2008. imajući u vidu ekonomsku situaciju i kretanja na svjetskom tržištu koja će imati odraza na poslovanje Željeznica FBiH.
Planirana pokrivenost troškova prihodima iznosi 112,2 posto. Od željezničkih usluga očekuje se prihod od 82.143.500 KM i dobit kompanije u iznosu 580.000 KM.
U skladu s predviđenim obimom poslova planirani su radovi na tekućem i investicijskom održavanju mobilnih kapaciteta, te ulaganja u infrastrukturne trase i kapacitete.