Prevost je naišao na kritike zagovornika preživjelih žrtava zlostavljanja od strane klera zbog svog postupanja u slučajevima optužbi za seksualno zlostavljanje tijekom njegova vodstva u augustinskom redu i u Peruu. Grupa za zagovaranje SNAP navodi da Prevost nije poduzeo mjere protiv optužbi za zlostavljanje koje su uključivale Richarda McGratha, bivšeg ravnatelja srednje škole Providence Catholic, dopuštajući mu da ostane na poziciji unatoč dugotrajnim optužbama.