Sud BiH potvrdio je 3. januara 2008. godine optužnicu protiv Predraga Kujundžića koja ga tereti za krivično djelo zločin protiv čovječnosti.
Prema navodima optužnice Kujundžić je, u periodu od proljeća 1992. do jeseni 1993. godine, postupajući kao komandant jedinice „Predini vukovi“, u sklopu napada vojske i policije tzv. Srpske republike BiH, te paravojnih formacija, usmjerenog na nesrpsko stanovništvo općine Doboj, izvršio, podsticao i pomagao ubistva, prisiljavanje na seksualno ropstvo, silovanje, teško oduzimanje fizičke slobode, progon nesrpskog civilnog stanovništva, kao i druga nečovječna djela. U optužnici se, takođe, navodi da optuženi Predrag Kujundžić iako je znao, nije spriječio ove radnje koje su činile njemu podređene osobe, niti je kaznio izvršioce.