Bajrektarević je, nakon hapšenja, predat postupajućem tužiocu koji ga je ispitao u svojstvu osumnjičenog, nakon čega je prema Sudu BiH uputio prijedlog za određivanje pritvora od mjesec dana, saopšteno je iz Tužilaštva BiH.
Pritvor je predložen i zbog okolnosti koje ukazuju da postoji opasnost od bjekstva osumnjičenog, kao i zbog bojazni da bi boravkom na slobodi, u nastojanju da omete i onemogući vođenje krivičnog postupka protiv njega, pokušao izvršiti uticaj na svjedoke, saučesnike ili pomagače.
Bajrektarević je osumnjičen da je kao pripadnik Petog korpusa takozvane Armije BiH počinio mučenja, zlostavljanja i silovanja ratnih zarobljenika, pripadnika odbrane Autonomne Pokrajine Zapadna Bosna, koji su bili zatvoreni u improviziranom zatvoru u tadašnjem motelu "Radoč" u Bužimu.
