Dva puta je došao u apostolski pohod Bosni i Hercegovini, 12. i 13. aprila 1997. u Sarajevu i 22. juna 2003. u Banjoj Luci gdje je proglasio i prvog blaženika rođenog na prostorima BiH dr. Ivana Merza.
Na konferenciji za novinare, održanoj u petak u prostorijama Nadbiskupskog ordinarijata vrhbosanskog u Sarajevu, kardinal Vinko Puljić osvrnuo se na obljetnicu smrti pape Ivana Pavla II, kao i na planiranu izgradnju spomenika papi pred sarajevskom katedralom.
"Ovo je dan kada će mnogi vjernici uputiti svoje molitve posebno za Ivana Pavla II, a još više Ivanu Pavlu II jer su mnogi moleći njegov zagovor doživjeli uslišanje svojih potreba i molitvi. Mi ne možemo i ne smijemo zaboraviti tog velikog papu koji je imao toliko srca i bio je glasnik mira za BiH.
Na žalost, spomenik koji spremamo i organiziramo podići pred katedralom ne ide tako jednostavno. U BiH ništa ne ide jednostavno. Sve mora biti složeno pa i ovaj spomenik. Živo se nadam da će pobijediti dobra volja i potpora onih koji istinski smatraju vrijednim da podignemo taj spomenik pred katedralom", kazao je kardinal Puljić, javila je KTA.